提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
推荐阅读
网投彩票最赚钱超模Kendall Jenner | 凭什么成卡戴珊家族一股清流
2023-10-05
网投彩票巴黎圣母院大火是对所有古建警醒
2023-09-25
网投彩票有多项调整 不发行5元纸币
2023-09-28
网投彩票"乐清失联男孩"母亲报假警一审被判1年3个月
2023-09-19
网投彩票伦敦希思罗机场北部城镇集装箱仓库起火 现场黑烟滚滚
2024-03-09
网投彩票独立经济学者李少魁:香港制造业空心化的前车之鉴
2023-07-23
网投彩票 德国百年煤矿倒闭后,被改造成热门旅游景点,获评世界文化遗产
2023-10-06
网投彩票东方园林欠薪事件:六成员工被"优化"
2023-09-19
网投彩票一图详解!海军70周年阅兵中外舰艇亮点预测
2024-02-03
网投彩票《死亡搁浅》现实隐喻孤独与连接
2024-04-20
网投彩票 真人"黑寡妇"?俄罗斯"最美女兵"出炉:金发及腰 枪法精准
2023-09-20
网投彩票哈佛女神这样甩低效努力
2023-10-17
网投彩票新华全媒+丨变异株CH.1.1 最新解读来了
2024-01-03
网投彩票 抄袭出的经典:荒野大镖客
2023-11-18
网投彩票高烧工房:TABOR挖起杆测评
2023-08-30
网投彩票美国又一盟友力挺华为:不会威胁国家安全
2024-01-26
网投彩票红魔3配风扇究竟咋样?
2024-01-13
网投彩票罗永浩宣布小野电子烟上市:前员工开发、锤子设计
2023-11-17
网投彩票车停半年会发生这么大变化!
2024-05-09
网投彩票爱30年为何不敌相识两年
2023-09-28
网投彩票“一带一路”沿线国家农产品进京 丰富北京“菜篮子”
2024-05-01
网投彩票吴京谈流浪地球盗版:砸创作者饭碗
2024-05-31
网投彩票高校师生研发眼球控制轮椅
2024-02-01
网投彩票中方回应美两艘军舰通过台湾海峡
2023-08-11
加载更多 网投彩票地图